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O Planos Mestres de Portos consideram cada porto do país dentro de uma região de abrangência, além de ampliar a análise sobre a retro área e sobre as características ambientais e sociais de cada unidade. O Plano Mestre está na parte tática do planejamento setorial, trazendo um diagnóstico sobre como está a situação do porto, as estimativas de cargas futuras para ele, identificando os gargalos. Ele é uma etapa dentro da cadeia de planejamento do setor portuário, que se inicia com o PNL (Plano Nacional de Logística) e passa pelo Plano Setorial de Portos.